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원격 저장소에 푸시 (Push)하기 원격 저장소에 푸시 (Push)하기 PC의 로컬 저장소에서 변경된 이력을 원격 저장소에 공유하려면, 로컬 저장소의 변경 이력을 원격 저장소에 업로드해야 한다. 웹 상의 원격 저장소로 변경된 파일을 업로드하는 것을 Git에서는 푸시(Push)라고 한다. push 를 실행하면, 원격 저장소에 내 변경 이력이 업로드되어, 원격 저장소와 로컬 저장소가 동일한 상태가 된다. 2021. 12. 10.
수정하고 커밋 (Commit)하기 수정하고 커밋 (Commit)하기 수정한 것을 저장하는 것을 커밋 (commit)이라 한다. 따라서 파일 및 폴더의 추가/변경 사항을 저장소에 기록하려면 'commit'이란 버튼을 눌러줘야 한다. commit 버튼을 누르면 이전 commit 상태부터 현재 상태까지의 변경 이력이 기록된 commit (혹은 리비전)이 만들어진다. 각 commit에는 영문/숫자로 이루어진 40자리 고유 이름이 붙는다. 저장소에선 이름을 보고 각 commit을 구분하고 선택한다. commit은 이력을 남기는 중요한 작업이기 때문에 commit 버튼을 누를땐 commit 메시지를 필수로 입력해야 한다. 메시지가 없으면 commit이 실행되지 않는다. 2021. 12. 10.
브랜치 (Branch) 생성하기 브랜치 (Branch) 생성하기 브랜칭(Branching)은 하나의 저장소에서 서로 다른 버전을 동시에 작업하는 방법이다. 기본적으로 저장소는 "master"라는 이름의 main branch를 가진다. master 외의 다른 branch를 만들어서 master에 commit하기 전에 수정하고 테스트한다. master 외의 branch가 만들어지면 그 순간에 master의 카피 혹은 스냅샷이 생성된다. 새로운 branch에서 작업하는동안 누군가 master branch를 수정한다면 그 update를 풀 (pull)받을 수 있다. 2021. 12. 10.
저장소(Repository) 생성과 사용 저장소(Repository) 생성과 사용 저장소 (Git repository)란 말그대로 파일이나 폴더를 저장해 두는 곳이다. Git 저장소가 제공하는 좋은 점 중 하나는 파일이 변경 이력 별로 구분되어 저장된다는 점이다. 비슷한 파일이라도 실제 내용 일부 문구가 서로 다르면 다른 파일로 인식하기 때문에 파일을 변경 사항 별로 구분해 저장할 수 있다. Git은 원격 저장소와 로컬 저장소 두 종류의 저장소를 제공한다. 원격 저장소(Remote Repository): 파일이 원격 저장소 전용 서버에서 관리되며 여러 사람이 함께 공유하기 위한 저장소 로컬 저장소(Local Repository): 개인 PC에 파일이 저장되는 전용 저장소 평소에는 개인 PC의 로컬 저장소에서 작업하다가 작업한 내용을 공개하고 싶.. 2021. 12. 10.
깃허브 (GitHub)란? 깃허브 (GitHub) 분산 버전 컨트롤 소프트웨어 깃 (Git)을 기반으로 소스 코드를 호스팅하고, 협업 지원 기능들을 지원하는 Microsoft의 웹서비스 코드 호스팅 서비스 외에도 다양한 기능들을 제공하고 있다. 깃 저장소를 원격에서 관리할 수 있을 뿐만 아니라 협업이 가능하도록 웹 서비스로 이슈 트랙커를 제공하고 있다. 또한 저장소를 자신의 계정에 복사할 수 있는 포크 기능과 코드 변경 사항 반영을 요청하는 풀리퀘스트 기능은 오픈 소스의 기본적인 협업 방식으로 자리 잡았다. 깃으로 사용할 수 있는 기능을 웹 인터페이스로 사용할 수 있으며, 저장소 관련 통계, 저장소 위키, 정적 웹사이트 호스팅, 패키지 호스팅, 지속적 통합을 제공하는 깃허브 액션 등의 서비스를 제공하고, GitHub Desktop.. 2021. 12. 10.
[Computational Neuroscience] Adaptive Exponential Integrate and Fire model (AdEx) Adaptive Exponential Integrate and Fire model (AdEx) good neuron model이 되기 위한 조건 - Can predict spike times - Can predict subthreshold voltage - Can interpret easily (not a ‘black box’) - Can account flexibly for a variety of phenomena - Can optimize parameters for systematic procedure 1-dimensional (nonlinear) integrate and fire 모델에서는 다양한 dynamics를 표현할 수 없다. 따라서, best choice 𝑓 : linear + exponen.. 2021. 12. 9.
[Computational Neuroscience] Leaky Integrate and Fire Model (LIF) Leaky Integrate and Fire (LIF) leaky integrate and fire 모델에서는 membrane을 resistor-capacitor (RC) 회로화 그리고 cell로 external current가 injecting하는 것을 모델링 한다. Kirchhoff’s rule에 의해 모든 전류의 합은 0이 됨을 안다. 이것은 external current이 resistive current와 capactive current의 합임을 의미한다. cell은 외부에 대해 음전하를 띠고 있고 membrane이 매우 얇기 때문에 음전하가 membrane 내부를 따라 축적되고 외부에서 양전하를 끌어당긴다. 이것은 membrane이 capacitor 역할을 한다는 것을 의미한다. membrane.. 2021. 12. 9.
[Computational Neuroscience] Dendrites and Synapses (2) Spatial Structure : The Dendritic Tree 피질과 뇌의 다른 영역에 있는 뉴런은 종종 수백 미크론 이상 확장될 수 있는 고도로 발달된 수지상 나무를 나타낸다. 뉴런에 대한 시냅스 입력은 대부분 수지상 나무에 있다. NMDA 또는 칼슘 기반 전기 발생 '스파이크'를 무시하면 축삭 언덕 근처의 체세포에서 활동 전위가 생성된다. 지점 뉴런의 전기적 특성은 시냅스 전류와 막에 걸친 다른 가로 이온 전류에 의해 충전되는 커패시터로 설명된다. 수지상 나무와 체세포에서 막 전위의 불균일한 분포는 수상 돌기를 따라 추가적인 종방향 전류를 유도한다. Spatial Structure : Axons 주어진 뉴런에는 시냅스 접촉을 만들기 위해 체세포를 떠나는 단일 축삭이 있다. 수상 돌기와 마찬가지.. 2021. 12. 9.
[Computational Neuroscience] Dendrites and Synapses (1) Dendrites and Synapses 뉴런은 복잡한 형태를 가지고 있다. 세포의 중앙 부분은 유전 정보와 분자 기계의 많은 부분을 포함하는 체세포이다. 체세포에서 두 가지 다른 긴 철사 모양의 확장이 시작된다. 첫째, 수상돌기는 시냅스가 위치하는 다수의 작거나 큰 가지를 형성한다. 시냅스는 다른 뉴런 (즉, '시냅스 전' 세포)의 정보가 도착하는 접점이다. 둘째, 체세포에서 뉴런이 목표 뉴런에 활동 전위를 보내는 데 사용하는 축삭도 시작된다. 전통적으로 체세포와 축삭 사이의 전이 영역은 스파이크를 보낼지 여부를 결정하는 중요한 영역으로 간주된다. Synapses 두 종류의 이온 채널, 즉 전압 활성화 이온 채널과 칼슘 활성화 이온 채널을 접한다. 다루어야 하는 세 번째 유형의 이온 채널 시냅스 전달과.. 2021. 12. 9.
[Computational Neuroscience] Hodgkin-Huxley model (HH model) Hodgkin-Huxley model (HH model) Hodgkin과 Huxley는 Cambridge University 학부생으로, giant axon of the squid에 대한 실험을 수행했고 세 가지 다른 유형의 ionic current인 sodium current, potassium current 및 Cl(−) ion으로 구성된 leak current를 발견했다. 이에 action potential 모델에 필요한 정보를 도출할 수 있었다. Hodgkin과 Huxley는 action potential를 정확하게 예측하고 묘사할 수 있는 방정식을 개발했다. 우리가 직접 관찰할 수 없는 뉴런의 생물학적 특성을 모방하는 데 사용될 수 있는 계산 모델링의 초석이 되었다. 실제, Hodgkin-Hux.. 2021. 12. 9.
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