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[YASA] Data loading and preprocessing (Polysomnography data) (1) 수면다원검사 (Polysomnography data) MNE 패키지를 사용하여 Python에서 데이터를 로드하고 전처리한다. >>> import mne >>> raw = mne.io.read_raw_edf('yasa_example_night_young.edf', preload=True) >>> raw YASA는 PSG 데이터를 시각화하거나 스크롤하는 것을 허용하지 않는다. 그러나 이것은 무료 EDFBrowser 소프트웨어를 사용하여 수행할 수 있다. 채널 선택 채널 이름은 다음과 같이 표시할 수 있다. >>> print(raw.ch_names) ['ROC-A1', 'LOC-A2', 'C3-A2', 'O2-A1', 'C4-A1', 'O1-A2', 'EMG1-EMG2', 'Fp1-A2', 'Fp2-A1', .. 2022. 4. 25.
[YASA] Prerequisites Prerequisites 이것은 주로 신규 사용자를 대상으로 하는 YASA에 대한 소개이다. 그러나 약간의 Python, 특히 NumPy 및 Pandas 와 같은 라이브러리를 알아야 한다. 이 튜토리얼은 또한 기본 수면 연구 및 수면다원검사 (PSG) 데이터 분석 방법에 익숙하다고 가정한다. 터미널 또는 Anaconda 명령 프롬프트를 열고 다음을 입력하여 최신 버전의 YASA를 설치해야 합니다. pip install --upgrade yasa 컴퓨터에 다음 두 파일을 다운로드해야 한다. 파일은 이 노트북과 같은 폴더에 저장해야 한다. PSG 데이터는 유럽 데이터 형식 (.edf)으로 저장된다. 22세의 건강한 여성의 Full-night. PSG 기록에는 19개의 EEG, 2개의 EOG, 1개의 EMG .. 2022. 4. 25.
Visbrain Visbrain Visbrain은 뇌 신호 시각화 전용 오픈 소스 Python3 패키지이다. VisPy 및 PyQt를 기반으로 하며 3-Clause BSD 라이선스에 따라 배포된다. # Regular installation pip install -U visbrain # Update visbrain pip install --upgrade visbrain http://visbrain.org/index.html Contents — visbrain 0.4.6 documentation visbrain.org 2022. 4. 22.
YASA (Yet Another Spindle Algorithm) YASA (Yet Another Spindle Algorithm) YASA (Yet Another Spindle Algorithm)는 Python 수면 분석 도구 상자이다. 수면다원검사 데이터의 자동 수면 스테이징 (기사 참조) 이벤트 감지 : 단일 또는 다중 채널 EEG 데이터에서 수면 방추, 느린 파장 및 빠른 안구 움직임. 단일 또는 다중 채널 EEG 데이터에 대한 인공물 거부. 스펙트럼 분석 : 대역 전력, 위상 진폭 커플링, 1/f 기울기 등 최면 분석 : 수면 통계 및 단계 전환 # Installation pip install --upgrade yasa https://raphaelvallat.com/yasa/build/html/index.html# Installation — yasa 0.6.1.. 2022. 4. 22.
SleepECG SleepECG ECG 데이터를 이용한 수면 단계 분류 패키지이다. # Installation pip install sleepecg # Alternatively, install via conda conda install -c conda-forge sleepecg # All optional dependencies can be installed with pip install sleepecg[full] https://sleepecg.readthedocs.io/en/stable/ SleepECG Next Datasets sleepecg.readthedocs.io 2022. 4. 22.
수면 무호흡증 진단 수면 무호흡증 (obstructive sleep apnea) 무호흡은 외비공과 구강을 통한 호흡이 10초 이상 정지하고 호흡의 크기가 기본치의 80% 이상 감소된 경우이며, 저호흡 (hypopnea)은 호흡이 10초 이상 정지하고 기본치의 50% 이상 감소되거나 호흡이 감소되면서 각성 혹은 4% 이상 산소포화도 저하가 동반된 경우이다. 저호흡에 대해서 이후 미국 수면학회에서 제시한 다 른 기준이 있기는 하나 어떤 기준을 사용하든 사용했던 기준을 잘 기술하고 일관성을 가지면 될 것이다. 수면중 무호흡과 저호흡의 횟수를 합하여 총 수면시간으로 나눈 값을 무호흡-저호흡 지수 (apnea-hypopnea index, AHI)라 하는데 이 값이 5 이상일 때 수면 무호흡증으로 진단한다. 또한, 무호흡-저호흡 지수.. 2022. 4. 22.
기면증 진단 기면증 (narcolepsy) 기면증의 호발연령은 15-25세이며 35-45세가 발병하는 경우도 있다. 기면증의 유병률은 나라마다 차이는 보이지만 대체로 0.02- 0.05%로 보고되고 있다. 기면증의 4대 증상은 주간졸림증, 탈력발작, 수면마비, 입면시 환각이며 야간 수면장애를 더하여 5대 증상이라고도 한다. 탈력발작은 기면증의 특징적인 증상으로 웃거나 화가 나거나 하는 감정반응에 촉발되어 근육의 긴장이 저하되는 현상으로 고개를 떨구는 경한 증상에서 무릎을 꿇거나 완전히 바닥에 쓰러지는 것까지 그 정도는 다양하다. 의식은 유지되고 수초에서 수분간 지속되다가 저절로 회복된다. 제 2판 국제수면질환 분류에서는 탈력발작이 있는 기면증과 탈력발작이 없는 기면증으로 구분하고 있다. 진단시 MSLT에서 평균수면잠.. 2022. 4. 22.
과수면증 진단 과수면증 (hypersomnia) 과수면 혹은 주간졸림증은 주관적, 객관적인 평가로 나누어서 생각할 수 있다. 주관적인 평가의 가장 대표적인 척도는 주간졸림증 척도 (epworth sleepiness scale, ESS)이고 객관적인 평가로써 가장 많이 사용되는 검사는 수면잠복기 반복 검사 (multiple sleep latency test, MSLT)이다. ESS는 8개의 문항으로 구성되 어 있으며 각 문항당 3점으로 총 점수가 10점을 초과하면 병적인 주간졸림증이 있는 것으로 판정한다. MSLT는 오전 9시부터 2 시간 간격으로 오후 5시까지 총 5회 실시하고 각 검사는 20분 내지 30분 동안 진행된다. 어두운 방에서 환자는 자도록 지시를 받고 5 회 검사를 통해 환자가 잠이 드는 수면잠복기의 평균.. 2022. 4. 22.
수면질환 진단 (Diagnosis of sleep diseases) 수면질환 진단 (Diagnosis of sleep diseases) 수면은 무의식을 유지하는 상태를 말하며, 신체 및 정신에 휴식을 제공하여 건강을 회복, 유지시켜주는 과정을 말한다. 수면은 안구운동의 조절이 가능한 각성 상태로부터 얕은 잠인 1단계를 거쳐 4단계의 깊은 잠까지 진행되고, 그 후 REM 수면 단계를 거쳐 꿈을 꾸는 상태가 된다. REM 수면 시 뇌의 상태는 낮은 전압의 뇌파를 포함하여 신경 활동이 깨어있을 때와 비슷하지만 신체 근육은 무력한 상태를 보인다. 이러한 수면은 수면 상태에서 관찰되는 일정한 뇌파를 사용하여 단계를 구분한다. 뇌파란 사람의 두피 상의 두 점 사이의 전위 변동을 연속적으로 기록한 신호를 말한다. 그림은 인간의 수면 단계를 히스토그램으로 나타낸 것으로 가로축은 수면시.. 2022. 4. 22.
Masks Nasal masks 처음 양압기를 사용하는 사람에게 추천되는 가장 일반 형태의 마스크. 쿠션 (마스크)으로 코 윗부분만 덮는 방식이다. 크기 문제가 없다면 착용 시 거의 이물감을 느끼지 않는다는 장점이 있다. 하지만 입을 벌리고 자는 습관이 있는 사람은 공기압이 입으로 새어나와 양압기 효과를 떨어뜨림은 물론 소음을 유발하기도 한다. 또한 코 밑 수염을 기르거나 수염이 짙게 빨리 자라는 사람은 인중 부분의 수염이 실리콘 쿠션의 밀착을 방해하기 때문에 공기가 새는 느낌을 받을 수도 있다. Nasal pillows 콧구멍에 공기 관을 직접 연결하는 형태의 마스크로 얼굴에 닿는 면적이 최소화하기 때문에 덜 덥고 피부 걱정도 적다. 하지만 고압의 공기가 코에 직접 들어가면서 코 내부가 심하게 자극되고 건조해지기.. 2022. 4. 19.
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